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福建省肿瘤医院 垒土沙龙学术讲座第83期 林万尊

在肿瘤研究领域,相信没有人不知道The Cancer Genome Atlas (TCGA)。TCGA是美国国家癌症研究所和美国人类基因组研究所共同监督的一个项目,旨在应用高通量的基因组分析技术,以帮助人们对癌症有更好的认知,从而提高对于癌症的预防、诊断和治疗能力。作为目前最大的癌症基因信息数据库,TCGA的全面不仅仅体现在众多癌型上(覆盖33种癌症类型,超过30000例肿瘤样本),还体现在多组学数据(包括基因表达数据、miRNA表达数据、拷贝数变异、DNA甲基化、SNP等)。
TCGA作为肿瘤研究中资源最丰富,数据最权威的数据库,自然受到广大科研工作者的深入挖掘。无数的文章脱胎于通过挖掘TCGA数据,但TCGA数据库的分析往往需要复杂的代码,这也促使了衍生的数据库用于挖掘可视化TCGA这个巨大的资源。
本期垒土沙龙活动(83期)我们邀请到复旦大学上海医学院肿瘤学林万尊博士,为我们带来主题为“零代码挖掘TCGA数据库”的演讲。本次演讲中,林万尊博士将通过讲解TCGA衍生数据库的使用,从而便捷实现零代码分析TCGA数据库。相信通过林博士的讲解,大家都可以轻松迈过TCGA数据下载这一步,灵活的操作自己的数据为自己所用。
本次沙龙同时邀请了福建省肿瘤医院肿瘤内科刘珺博士、厦门大学附属中山医院呼吸内科徐贻佺博士以及福建省肿瘤医院放疗科黄宗伟硕士共同参与讨论。相信通过各位专家的学术交流,我们定能掌握对TCGA数据有效收集和处理的方法,将其轻松揽入囊中。欢迎各位同仁认真聆听并踊跃参与!
主讲人:林万尊 博士
主持人:邱素芳 主任医师

复旦大学上海医学院肿瘤学博士在读,从事放射治疗与肿瘤免疫研究。以第一作者/共同第一作者,在Theranostic,Ebiomedicine,Cell Death and Disease等杂志发表相关SCI论文。

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